EcoR 1,Xho 1酶切位点双酶切切不下来 急
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各位大侠帮帮忙啊
我最近把PCR产物(260 bp)克隆到了pMD-19上,经测序序列也是正确的!但是我用双
酶切时(体系是20 ul,质粒加了2ul),目的条带非常暗(与载体亮度相差很大),根
本没法回收!我设计的引物上游带有EcoR 1酶切位点,下游带有Xho 1酶切位点,载体
上有EcoR 1酶切位点。
请教各位大侠是什么原因!是我酶切的时候质粒加少了还是其他原因!谢谢
多切点质粒吧,260bp的条带很暗是正常的拉
同意楼上的观点,往往切下的片断越小条带越暗。
我们做双酶切时,一般是30ul的体系切6ul的质粒,
看看有否引入甲基化位点
我就用这两个酶,有时候就是怀疑是否酶切完全,比如做连接的时候,切了6个小时,还是有自连的情况。我觉得你可以先测一下质粒的浓度,然后决定你的体系加多少质粒。我觉得2微升太少。
分别用这两个酶切下
看能不能放出全长(是否切开)
假如切开了,应该没有问题。可以加大体系。我们经常用50UL体系回收
再有假如测序对了,但是切不开,一个可能的原因就是甲基化了
可以转化到不含甲基化酶的菌 中 再酶切就OK了
我们实验室有个也碰到了和你相同的问题
最后就是用不含甲基化酶的感受态菌解决的问题!
目的条带非常暗(与载体亮度相差很大):
假如有目的条带那么一般情况下是切开了。载体的亮度大是因为载体的碱基数目多自然亮些。260bp相对于载体应该不会很亮
假如只是这两条带应该是正确的
最好把图发上来大家看下会更好!
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