TA克隆问题求救
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连接液转化涂板后长了满满一平板,采用菌落PCR筛选,取4个PCR阳性的菌落提质粒,然后用PstI&BamHI 双酶切,电泳结果表明,均没有切出2kb的目的带,只在约4kb的地方有条很粗的带。
怀疑是pMD18-T载体自连,但将上述所提取的质粒分别用SalI ,XamI单酶切,电泳时用未经酶切的质粒做对照,结果单酶切和对照的带型几乎一样(最粗的一条在约8kb处)。
另外,我用提取的质粒为模板PCR ,也能扩增出目的带。
我能排除酶本身的问题,现在都不知道问题出在哪了,请问各位高手
你有没有排除一下感受态细胞污染的问题啊,要是感受态细胞污染,已经含有一个质粒的话,你的质粒是很难再转进去了。后面的实验也很难做对了。而且连接液转化涂板后长了满满一平板,连接产物转化效率有这高,有点怀疑啊!你以前的实验连接产物转化效率也是这么高吗
希望大家也指点一下,我昨天做的连接产物的转化和楼主出现了一样的情况,但我昨天做了空白对照,排除了感受态污染的原因。我以前还没出现连接产物转化可以长满板子的情况,希望大家给点意见。
我昨天做的三个转化,两个是将目的片段连接pMD19-T simple vector 长了20多个,还比较正常,但是目的片段连接别的PCDNA3.1却长满了.不明白是怎么回事,希望大家指点.谢谢了
我也初步推测是感受态污染,昨天用实验室一师兄最近做的感受态重新转了一次,才涂了100ul,今早上观察平板上还是长了不下100个。现在正做菌落PCR筛选。
关于连接产物长满平板的情况我见过,我当时用的载体是pUC18,个人觉得pUC18来源的载体很轻易转化。
juejueok wrote:
希望大家也指点一下,我昨天做的连接产物的转化和楼主出现了一样的情况,但我昨天做了空白对照,排除了感受态污染的原因。我以前还没出现连接产物转化可以长满板子的情况,希望大家给点意见。
我昨天做的三个转化,两个是将目的片段连接pMD19-T simple vector 长了20多个,还比较正常,但是目的片段连接别的PCDNA3.1却长满了.不明白是怎么回事,希望大家指点.谢谢了
"PCDNA3.1却长满了" 是载体没有切干净吧,做个自连的对照就知道了。
wangfeiyan wrote:
连接液转化涂板后长了满满一平板,采用菌落PCR筛选,取4个PCR阳性的菌落提质粒,然后用PstI&BamHI 双酶切,电泳结果表明,均没有切出2kb的目的带,只在约4kb的地方有条很粗的带。
怀疑是pMD18-T载体自连,但将上述所提取的质粒分别用SalI ,XamI单酶切,电泳时用未经酶切的质粒做对照,结果单酶切和对照的带型几乎一样(最粗的一条在约8kb处)。
另外,我用提取的质粒为模板PCR ,也能扩增出目的带。
我能排除酶本身的问题,现在都不知道问题出在哪了,请问各位高手
1、做个感受态的板子,看看感受态是否污染;
2、“连接液转化涂板后长了满满一平板”建议做个载体自连的对照看看载体有没有问题,假如载体自连太多了找厂家更换。
3、换不同批号pMD18-T载体再试一次。
连接的是否片段一定要定量的,不定量不计算摩尔比最不可取了。
Novelgene wrote:
1、做个感受态的板子,看看感受态是否污染;
2、“连接液转化涂板后长了满满一平板”建议做个载体自连的对照看看载体有没有问题,假如载体自连太多了找厂家更换。
3、换不同批号pMD18-T载体再试一次。
连接的是否片段一定要定量的,不定量不计算摩尔比最不可取了。
要是载体自连的话,我用提取的质粒单酶切后电泳应该会出现载体大小的带,对吧?
wangfeiyan wrote:
要是载体自连的话,我用提取的质粒单酶切后电泳应该会出现载体大小的带,对吧?
是的,和Marker比一下分子大小。不要和没有经过酶切的超螺旋质粒比较,后者的比较个人认为没什么意义。
Novelgene wrote:
是的,和Marker比一下分子大小。不要和没有经过酶切的超螺旋质粒比较,后者的比较个人认为没什么意义。
可是我用XmaI&SalI分别单酶切所提取的质粒,电泳带形均和未经酶切的质粒电泳带形一样,可以看到四条带,与Maker比较,2条在10kb以上,较细,最粗的一条在约8kb处,还有一条细带在约4kb处。
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