关于扩增启动子之后载体构建的问题
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各位战友,请教一下问题,就是大家在构建带有报告基因的启动子区表达载体时,是如何选定启动子区的长度呢?
此外,假如在构建时启动子长度延至其基因的ATG之后,启动子是否会影响gus基因的表达呢?
请指教 ,多谢
顶一下
看你的描述,应该是做植物启动子活性或者是启动子功能分析的?
在没有实验验证所克隆的5‘侧翼片段具有启动子活性前,应该还不能称它是某某基因的启动子吧~
1。假如要验验证所克隆的5‘侧翼片段就是目的基因的启动子,则连入载体的5‘侧翼片段长度越长越好。因为你永远无法知道启动子的范围有多大,广义的启动子更包括了远侧的增强子和近侧的基础启动子区。而狭义的启动子特指基础启动子区,可以使用数据库猜测大约范围。所以要根据你的需要选择下一步的实验方案。
2。假如在构建时启动子长度延至其基因的ATG之后,启动子是否会影响gus基因的表达呢。
GUS基因可以融合表达。只要你构建完成后,保证翻译过程中GUS基因不移码就可以。我们实验室有人也采取这样的操作策略,结果没问题,GUS都能染色成功。查阅国外的文献,很多老外也是这样做的,不要当心。最要害的是融合后的GUS千万不能移码。
多谢 我还想请问一下 用那个数据库可以猜测其范围啊
我现在得到了该基因的5‘侧翼序列约1.6kb 正常情况下来讲 是不是应该能够包括近侧的启动子区域了?
一般认为是包括了近侧的启动子区域.
做植物的最常用的有两个
PLACE(http://www.dna.affrc.go.jp/PLACE/)
PLANCARE(http://bioinformatics.psb.ugent.be/webtools/plantcare/html/)
非常感谢
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